世界上很多国家已经拟定了生物柴油标准，从而保证柴油的质量，保证使用者更加放心的使用生物柴油。 主要对以下成份进行考评：生产制造的整个反映过程，甘油的去除情况，催化剂的去除情况，酒精的去除情况，以及确保不含游离脂肪酸。生物柴油的生产标准评定指针包括比重、动态粘度、闪火点、硫含量、残留量、十六烷值、灰份、水份、总杂质、三酸甘油脂、游离甘油等。生物柴油标准的规范，正在极大的推动生物柴油在这些国家的汽车工业中正式应用和合法化，同时，大量国家对生物柴油的认可也正在推动生物柴油作为一种新型可再生生物能源的国际化。
由于目前生物柴油在商用上主要以生物柴油和石化柴油的混合油的形式供应，因此，对于混合油也有标准推出。例如5%的生物柴油加95%的常规柴油的混合油需要达到2000年颁布的EN590（EN590:2000）的标准，凡是符合这一标准的混合油，都可以安全地应用于所有柴油机发动机，虽然这一混合油不需要添加任何稳定剂，但是国外也有提议称需要在EN 590:2000标准中增加这样一条：混合油中的生物柴油自身必须符合EN 14214的标准。 目前我国的质量标准如下：
| 生物柴油相关质量指标 检验方法 重要指标判断重要技术指标 | ||||
| 密度（20℃） /（kg/m ） 820~900 GB/T 2540 | 机械杂质 无 GB/T 511 | 铜片腐蚀（50℃，3h）/ 级 不大于 1 GB/T 5096 | 运动粘度（40℃）/（mm /s） 19~6.0 GB/T265 | 十六烷值 不小于 49 GB/T 386 |
| 闪点（闭口）/ ℃ 不低于 130 GB/T 261 | 氧化安定性（110℃）/小时 不小于 6.0 EN14112 | 酸值/（mgKOH/g） 不大于 0.80 GB/T 264 GB/T 5530 | 冷滤点 / ℃ 报告 SH/T 0248 | 游离甘油含量(质量分数)/ % 不大于 0.020 ASTM D 6584 |
| 硫含量(质量分数) / % 不大于 0.05 0.005 SH/T 0689 | 总甘油含量(质量分数) / % 不大于 0.240 ASTM D 6584 | 90%回收温度/℃ 不高于 360 GB/T 6536 | 10%蒸余物残炭(质量分数) / % 不大于 0.3 GB/T 17144 | |
| 硫酸盐灰分(质量分数) / % 不大于 0.020 GB/T 2433 | 可用GB/T 5526、GB/T1884、1885方法测定 | GB/T 380、GB/T 11131、GB/T 11140、GB/T 12700和GB/T 17040 方法测定，结果有争议时，以SH/T | 水含量（质量分数）/ % 不大于 0.05 SH/T 0246 | 可用GB/T 268方法测定，结果有争议时，以GB/T 17144仲裁 |
